疑难危重感染辅助诊断“利器”上新——首批病原宏基因组检测试剂审评记
中国食品药品网讯 (记者 张一) 面对不明原因高热、多器官衰竭的危重感染患者,临床救治要与时间赛跑,医生却常常感到疑惑:血培养、PCR反复送检,病原体却像“隐身”了一般。无法锁定“元凶”,就难以精准投放抗感染的“弹药”。
如今,新的辅助诊断“利器”获批上市。日前,国家药监局批准2个基于二代测序技术的病原宏基因组检测试剂注册申请。两款产品分别针对呼吸道感染和血流感染两大危急重症场景,样本一次检测,可同时提供多类别病原体信息。
“病原宏基因组检测技术理论上可以检测参考数据库覆盖的所有病原体基因,更大范围检出病原体。这意味着,医生可以更精准用药。”国家药监局医疗器械技术审评中心(以下简称器审中心)审评六部部长吕允凤说。
值得一提的是,两款产品分别是全球首款基于宏基因组检测技术的呼吸道病原体检测试剂和国内首款用于血流感染的宏基因组检测试剂,这标志着我国在宏基因组检测技术的转化上走在了世界前列。
填补临床空白
病原宏基因组检测技术的核心,在于不依赖培养,直接对样本中所有核酸进行广谱高通量测序,再通过生物信息分析结合临床诊疗信息“揪出”致病病原体。在参考数据库范围内的罕见真菌、胞内菌理论上都无处遁形。
这项技术的临床需求迫切。据统计,仅下呼吸道感染,我国每年的危急重症和疑难病例约达200万例。这类患者起病急、进展快,病原体复杂,能否在黄金窗口期内明确病因,直接关系生死。传统检测方法覆盖范围窄或时效性差,业界期望病原宏基因组检测技术可以给出高效“解法”。
事实上,病原宏基因组检测技术的应用已有探索。2014年,《新英格兰杂志》刊登了美国一家医院将该技术应用于临床病例检测的案例,在国际上引起广泛关注。在近年新发突发传染病防控中,宏基因组检测技术在识别病原体方面发挥了重要作用。
近年来,病原宏基因组检测已在国内部分头部三甲医院以医疗机构自行研制使用体外诊断试剂(以下简称医疗机构自制试剂)的方式先行使用,积累了一定的临床使用经验,但也存在医院自建数据库缺乏充分验证、质控标准不一等不足,限制了此技术的广泛使用。
“我们收到很多一线医生的反馈,希望这项技术能真正产品化,经过审评部门‘把关’。”吕允凤回忆道。
本次获批的两款产品历经多年研发成功,填补了同类产品的空白。其中,广州微远医疗器械有限公司的呼吸道病原体核酸检测试剂盒(联合探针锚定聚合测序法)用于疑似下呼吸道感染的急危重症、免疫功能缺陷患者以及疑难病例呼吸道感染的辅助诊断,天津金匙医学科技有限公司的血流感染病原体核酸检测试剂盒(可逆末端终止测序法)用于疑似血流感染同时血培养等常规诊断方法无法确认病原体的患者以及脓毒症等重症、危重症血流感染患者的辅助诊断,为临床疑难、危重、特殊感染病例的辅助诊断提供了更多选择。
产品化带来的一大变革,在于标准化质控体系的建立。从样本采集、核酸提取、文库构建、测序运行到生物信息分析,每一个环节都有了明确的操作规范和质量指标,检测结果的可靠性和可重复性大幅提升。
“产品化带来的标准化质控体系,让这项前沿技术真正有了走向基层、服务大众的可能。”同济大学附属东方医院南院检验科主任吴文娟说,医疗机构自制试剂只能局限于本院内部使用,而国家药监局正式批准上市的检测试剂则可以覆盖所有具有必备检测条件和检测能力的医疗机构,也可以通过区域检验中心协作或委托检测的方式,覆盖尚未具备本地化部署能力的医疗机构。这意味着,即便是一家偏远地区的县级医院,在建立规范的样本采集、冷链运输和远程报告咨询流程后,也能让当地危重患者获得与头部医院同等质量的检测服务。
审评摸索前行
面对这样全新的产品,审评团队首先要回答的是:怎么审?
“我们查询了全球主要监管机构,没有任何审评批准的参考。”吕允凤坦言,没有经验借鉴,没有现成框架,审评团队要“在白纸上画图”。
其实,病原宏基因组检测产品早在2022年就进入了审评关注重点方向中,针对此类技术,器审中心内部展开了多轮激烈讨论。
争议焦点在于,这项技术在生产端可以标准化,但在应用端,尤其是背景微生物控制、结果解读和临床决策上,却高度依赖实验室条件和人员经验。这类产品究竟应作为一项临床“新技术”由其他部门管理,还是可作为“诊断试剂产品”走医疗器械上市审评路径?
最终,器审中心决定“向前一步”。器审中心临床与生物统计二部副部长何静云告诉记者,只有通过产品化审评,才能统一质量标准、明确使用边界,从而更好保障患者安全,也让技术红利广泛惠及适宜人群。
方向定了,评价方法却依旧空白。为此,器审中心组织全国感染病学、检验医学、生物信息学等领域专家,反复研讨。
为确保产品经得起临床应用的检验,器审中心指导企业开展充分的临床试验。“仅仅如何科学设计临床试验一个问题,我们就召开了近十次专家论证会。”临床与生物统计二部项目管理人徐超回忆,讨论内容之细致,超乎意料:临床试验是评价全部病原体,还是选择代表性病原体?代表性病原体如何选择?样本量如何估算?如何进行统计分析……
经过反复碰撞,最终确定选取近40种具有代表性的病原体作为临床试验验证对象。
随后,企业在中国医学科学院北京协和医院、广州医科大学附属第一医院等多家头部临床试验机构开展大规模研究。两款产品临床试验历时两年,获得了较为充分的研究数据。对于验证范围内的病原体,在临床诊断为阳性且明确为病原体感染的病例中,两款产品的病原体检出率大于95%,且检出的各类病原体中,常规检测方法难以判断的病原体占比分别达28.53%和30%。
审评团队为此振奋,但也并未因此放松警惕。
宏基因组检测对实验室环境极为敏感,不同机构、不同季节、不同操作条件下,环境中固有的背景微生物均可能干扰检测结果。为此,审评团队提出一项“解决方案”——选取3家临床试验机构采集的样本,进行检测结果的重现性研究,以验证产品在不同实验室环境下的检测稳健性。
“这不是体外诊断试剂临床评价的常规要求,但对于病原宏基因组检测试剂的评价非常有价值,特别是在还没有同类产品上市的情况下,对于确认产品上市后的安全有效性有重要意义,因为只有经得起‘换环境’考验的产品,才能在全国各级医院推广。”何静云说。
类似这样的反复讨论和评价方法优化,在四年间多次上演。每一次“迭代调整”,都是对企业和审评团队的双重磨砺,也是为了让安全底线更牢、临床信心更足。
“从零起步,一步步搭建起涵盖性能评价、临床验证、生信分析、环境质控在内的完整审评体系,这条新路走得艰难,但每一步都踩得扎实。”吕允凤说。
监管与技术共成长
“让新产品、新技术切实解决临床所需是审评部门不变的初心。”在吕允凤看来,从收到注册申请到产品获批的四年亦是监管能力与技术演进“同频共振”的四年。
这份初心,首先体现在对临床应用“最后一公里”安全底线的坚守上。
病原宏基因组检测技术虽在产品端实现了标准化,但实验室环境、操作规范、结果解读等使用端因素,同样直接关系患者安全。为此,器审中心主动协调国家卫生健康委临床检验中心(以下简称临检中心),共同探讨如何规范临床实验室的准入门槛与操作标准,推动形成了《宏基因组高通量测序技术临床实验室规范化应用指南(2026版)》。
器审中心与临检中心达成共识,在产品上市前,就必须同步建立实验室能力要求和质控指南,确保每一家开展该检测的医院都具备合格的环境条件、人员资质和结果判读能力。也就是说,产品获批之日,临床应用的“安全护栏”也一并到位,不让患者用械安全的“最后一公里”出现真空地带。
这份初心,同样体现在提升全产业链质量意识之中。宏基因组检测对样本采集、核酸提取、文库构建、测序运行到生物信息分析的每一个环节,都要求极严格的微生物控制。任何一处微小的污染或背景菌干扰,都可能导致结果偏差。审评过程中,团队将关注点从最终产品延伸至上游供应链,要求企业对引物、酶、接头、试剂盒耗材等关键物料建立可追溯的质控标准,并对供应商进行定期审核与验证。
四年来,企业按照审评部门建议不断优化生产工艺、供应链管理和质控体系。可以说,审评的“高压线”倒逼企业从源头抓质量,不仅提升了产品本身的稳定性,更带动了整条产业链——从原材料供应商到物流冷链,从生产车间到终端实验室——质量意识和管控能力的全面升级。
更为深远的意义在于,这四年积累的审评经验正转化为可复用的制度成果。据介绍,器审中心已联合中国药品检定研究院、临检中心针对病原宏基因组检测技术开展多项监管科学研究,系列指导原则正在路上。
审评员们也在为后续相关产品的审评加强知识储备。在吕允凤的办公桌上,放着一本由中国医学科学院北京协和医院检验专家杨启文编写的《mNGS报告解读实践与进展》。书页间密密麻麻的勾画和批注,见证了她无数个研读的夜晚。“这本书对我理解宏基因组测序技术的底层逻辑和临床边界帮助极大。”她说,还有多款产品正在研发和审评轨道上有序推进。
(责任编辑:常靖婕)
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